Desde la versión 1.6 de prestashop se ha incorporado una condición al archivo .htaccess que limita una buena funcionalidad de optimización. 

Cuando en Preferencias>Rendimiento escogemos "Optimizar Apache" se añaden al archivo .htaccess 8 lineas que le dicen al sistema:

¿Existe el módulo de apache de compresión?

Si- ¿Cumple uno de los siguientes filtros?
  Si- Pues comprime la página.

La diferencia con versiones anteriores, es que no estaba la cláusula filtros. Lo que hacía que con solo tener el módulo de apache mod_deflate fuera suficiente. Sin embargo ahora, si no tenemos instalado el módulo mod_filter.so, no nos funcionará dicha compresión.